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18S rDNA from 40 beetle species

Data matrix used in Maddison, D.R., Baker, M.D., and Ober, K.A. In press.A preliminary phylogenetic analysis of 18S ribosomal DNA of carabid beetles (Coleoptera: Carabidae). Boll. Mus. reg. Sci. nat. Torino.

Sites 1201 through 1300

Calybe        ATGGAATAATGGAACAGGACCTTGGTTCTATTTTGTTGGTTTAC-GGAAC--CCCAAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Cymindis      ATGGAATAATGGAACAGGACCTTGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAAC--CCCAAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Amara         ATGGAATAATGGAACAGGACCTTGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAAC--CCCAAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Agonum        ATGGAATAATGGAACAGGACCTTGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAAC--CCCAAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Discoderus    ATGGAATAATGAAACAGGACCTTGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAAC--CCCAAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Chlaenius     ATGGAATAATGGAACAGGACCTTGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAAC--CCCAAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Loxandrus     ATGGAATAATGGAACAGGACCTTGGTTCTATTTTGTTGGTTTCC-GGAAC--CCCAAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Pterostichus  ATGGAATAATGGAACAGGACCTTGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAAC--CCCAAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Galerita      ATGGAATAATGGAACAGGACCTTGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAATA-TCCAAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Pseudaptinus  ATGGAATAATGGAACAGGACCTTGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAAT--TCCAAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Pseudomorpha  ATGGAATAATGGAACAGGACCTTGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAAC--CCCAAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Morion        ATGGAATAATGGAACAGGACCTTGGTTCTATTTTGTTGGTTCCC-GGACC--CCCAGGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Psydrus       ATGGAATAATGGAACAGGACCTCGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAAC--TTCGAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Diplous       ATGGAATAATGGAACAGGACCTCGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAAC--CCCGAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Patrobus      A-GGAATAATGAA-CAGGACCTCGGTTCTATTTTGTTGGTTTTCC-GAAC--CCCGAGTTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Zolus         ATGGAATAATAGAACAGGACCTCGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAAC--AACGAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Sloaneana     ATGGAATAATGGAACAGGACCTCGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAAC--GACGAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Diplochaetus  ATGGAATAATGGAACAGGACCTCGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAAC--CCCGAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Pericompsus   ATGGAATAATGGAACAGGACCTCGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAAC--CCCGAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Bembidion     ATGGAATAATGGAACAGGACCTCG-TTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAAC--CCCGAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Asaphidion    ATGGAATAATGGAACAGGACCTCGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAAC--TCCGAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCCTTCGTATTGCGAC
Trechus       ATGGAATAATGGAACAGGACCTCGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAAC--CCCGAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Pasimachus    ATGGAATAATAGAATAGGACCTCGATTCTATTTTGTTGGTTTTG-AGAAT--TAAGAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTTGTATTGCGAC
Scarites      ATGGAATAATAGAATAGGACCTCCGTTCTATTTTGTTGGTTTTTGAGAAC--TTCGAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTTGTATTGCGAC
Clivina       ATGGAATAATAGAACAGGACCTCGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAAC--CCCGAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Schizogenius  ATGGAATAATAGAACAGGACCTCGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAAC--CCCGAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Dyschirius    ATGGAATAATAGAACAGGACCTCGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAAC--CCCGAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Loricera      ATGGAATAATATAATAGGACCTCGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAACATTCCGAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Calosoma      ATGGAATAATGGAACAGGACCTCGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAAC--CCCGAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Scaphinotus   ATGGAATAATGAAACAGGACCTCGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAACC-ACCGAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Elaphrus      ATGGAATAATAGAACAGGACCTCGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAAC--CCCGAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Blethisa      ATGGAATAATGAAACAGGACCTCGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAAC--CCCGAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Notiophilus   ATGGAATAATGGAACAGGACCTCGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAAC--CCCGAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Nebria        ATGGAATAATGGAATAGGACCTCGGTTCTATTTTGGTGGTTTTTTGGAAC--AATGAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Leistus       ATGGAATAATGGAACAGGACCTCGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAAC--CCCGAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
T. holmbergi  ATGGAATAATGGAACAGGACCTCGGTTCTATTTTGGTGGGGTTCCAGAAC--CCCGAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
T. gibbsii    ATGGAATAATGGAACAGGACCTCGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAAC--CCCGAGGTAATGATTAATAGGGACAGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Tenebrio      ATGGAATAATGGAATAGGACCTCGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAAT--TTTGAGGTAATGATTAATAGGAACGGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Dynastes      ATGGAATAATGGAATAGGACCTCGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAAC--TCCGAGGTAATGATTAATAGGAACGGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
Xanthopygus   ATGGAATAATGGAATAGGACCTCGGTTCTATTTTGTTGGTTTTC-GGAAC--TCCGAGGTAATGATTAATAGGAACGGATGGGGGCATTCGTATTGCGAC
                                                                                                                  
Character excluded from all analyses indicated by a = in the line under the matrix; boundary regions indicated by *