firstpreviousnext

[1-100] [101-200] [201-300] [301-400] [401-500] [501-600] [601-700] [701-800] [801-900] [901-1000] [1001-1100] [1101-1200] [1201-1300] [1301-1400] [1401-1500] [1501-1600] [1601-1700] [1701-1800] [1801-1900] [1901-2000] [2001-2100] [2101-2200] [2201-2300] [2301-2400] [2401-2411]


18S rDNA from 40 beetle species

Data matrix used in Maddison, D.R., Baker, M.D., and Ober, K.A. In press.A preliminary phylogenetic analysis of 18S ribosomal DNA of carabid beetles (Coleoptera: Carabidae). Boll. Mus. reg. Sci. nat. Torino.

Sites 1101 through 1200

Calybe        CGGTGCTCTTAATTGAGTGTCGAGGCGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCT--AATTAATGCCTGAATAATTA-GTGC
Cymindis      CGGTGCTCTTAATTGAGTGTCGAGGCGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCT--AATTAATGCCTGAATAATTA-GTGC
Amara         CGGTGCTCTTAACTGAGTGTCGAGGCGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCT--AATTAATGCCTGAATAATTA-GTGC
Agonum        CGGTGCTCTTAACTGAGTGTCGAGGCGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCT--AATTAATGCCTGAATAATTA-GTGC
Discoderus    CGGTGCTCTTAACTGAGTGTCGAGGCGGGCCGGCAC-TTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCT--AACTAATGCCTGAATAATTA-GTGC
Chlaenius     CGGTGCTCTTAATTGAGTGTCGAGGCGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAAAGTGCTCAAAGCAGGCT--TATTAATGCCTGAATAATTA-GTGC
Loxandrus     CGGTGCTCTTAATTGAGTGTCGAGGCGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCT--AATTAATGCCTGAATAATTA-GTGC
Pterostichus  CGGTGCTCTTAACTGAGTGTCGAGGCGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCT--AATTAATGCCTGAATAATTA-GTGC
Galerita      CGGTGCTCTTAATTGAGTGTCGAGATGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCT-ATATA-ATGCCTGAATATATAATTGC
Pseudaptinus  CAGTGCTCTTAATTGAGTGTTGAGGCGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCT--AAATAATGCTTGAATTGATAATTGC
Pseudomorpha  CGGTGCTCTTAATTGAGTGTCGAGGCGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTTAAAGCAGGCT--AATTAATGCCTGAATAATTA-GTGC
Morion        CGGTGCTCTTAATTGATTGTCGAGGCGGGCCGGCACTTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCT--ATTTAATGCCTGAATAATTA-GTGC
Psydrus       CGGTGCTCTTAATTGAGTGTCTCGGTGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCTAAAATT-TCGCCTGAATAC-TGTGTGC
Diplous       CGGTGCTCTTAATTGAGTGTCGAGGCGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCTAAAATT-TCGCCTGAATAC-TGTGTGC
Patrobus      CGGTGCTCTTAACTGAGTGTCGAGGCGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCTAAAATT-TCGCCTGAATAC-TGTGTGC
Zolus         CGGTGCTCTTAATTGAGTGTCGAGGCAGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCTAAAATT-TCGCCTGAATAT-TGTGTGC
Sloaneana     CGGTGCTCTTAATTGAGTGTCGAGGCGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCTAAAATT-TTGCCTGAATAT-TGTGTGC
Diplochaetus  CGGTGCTCTTAATTGAGTGTCGAGGCGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCTAAAATT-TCGCCTGAATAT-TGTGTGC
Pericompsus   CGGTGCTCTTAATTGAGTGTCGAGGCGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCTAAAATT-TCGCCTGAATAT-TGTGTGC
Bembidion     CGGTGCTCTTAATTGAGTGTCGAGGCGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCTAAAATT-TCGCCTGAATAC-TGTGTGC
Asaphidion    CGGTGCTCTTAACTGAGTGTCGAGGCGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCTAAAATT-TCGCCTGAATAC-TGTGTGC
Trechus       CGGTGCTCTTAATTGAGTGTCGAGGCGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCTAAAATT-TCGCCTGAATAT-TGTGTGC
Pasimachus    CAGTGCTCTTGACCGAGTGTTTTGCCAGGCCGGCCCATTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTTAAAGCAGGCAAAAATTTACGCCTGAATAA-TATGTGC
Scarites      CGGTGCTCTTAATTGAGTGTCTTGTCAGGCCAGCATATTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTTAAAGCAGGCAAAAATTTATGCCTGAATAT-TTTGTGC
Clivina       CGGTGCTCTTCACCGAGTGTCGAGGCAGGCCGACACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCTAAAATTTATGCCTGAATAT-TGTATGC
Schizogenius  CGGTGCTCTTCACCGAGTGTCGAGGCAGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCTAAAATTTACGCCTGAATAT-TGTGTGC
Dyschirius    CGGTGCTCTTAATTGAGTGTCGAGATAGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCTAAATTTAACGCCTGAATAT-TGTGTGC
Loricera      TGGTGCTCTTGATTGAGTGTCTCGGCAGGCTGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAAAGTGCTCAAAGCAGGCGAAAATT-ATGCTTAAATAG-TGTGTGC
Calosoma      CGGTGCTCTTAATTGAGTGTCGAGGCGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCTAAAATT-ACGCCTGAATAC-TGTGTGC
Scaphinotus   CGGTGCTCTTAATTGAGTGTCGAGGCGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTTAAAGCAGGCTAAAATT-TTGCCTGAATAT-TGTGTGC
Elaphrus      CGGTGCTCTTAATTGAGTGTCGAGGCGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCTAAAATT-TCGCCTGAATAC-TGTGTGC
Blethisa      CGGTGCTCTTAATTGAGTGTCGAGGCGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCTAAAATT-TCGCCTGAATAT-TGTGTGC
Notiophilus   CGGTGCTCTTAACTGAGTGTCGAGGCGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCTAAAACT-TCGCCTGAATAT-TGTGTGC
Nebria        CGGTGCTCTTAATTGAGTGTCGAGGCGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCTAAAATT-TCGCCTGAATAC-TCTGTGC
Leistus       CGGTGCTCTTAATTGAGTGTCGAGGCGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCTAAAATT-TCGCCTGAATAC-TGTGTGC
T. holmbergi  CGGTGCTCTTAATTGAGTGTCGAGGCGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCTAAAATT-TCGCCTGAATAT-TGTGTGC
T. gibbsii    CGGTGCTCTTAATTGAGTGTCGAGGCGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCTAAAATT-TCGCCTGAATAT-TGTGTGC
Tenebrio      CGGTGCTCTTCGTTGAGTGTCGAGGTGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTTAAAGCAGGCTAAAACT-TCGCCTGAATAC-TGTGTGC
Dynastes      CGGTGCTCTTTACCGAGTGTCGAGGTGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTTAAAGCAGGCTAAAATT-TTGCCTGAATAC-TGTGTGC
Xanthopygus   CGGTGCTCTTCACTGAGTGTCGAGGTGGGCCGGCACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTTAAAGCAGGCTAAAACT-TCGCCTGAATAC-TGTGTGC
                                                                                                                  
Character excluded from all analyses indicated by a = in the line under the matrix; boundary regions indicated by *