first previous next

[Return]

[1-100] [101-200] [201-300] [301-400] [401-500] [501-600] [601-700] [701-800] [801-900] [901-1000] [1001-1100] [1101-1200] [1201-1300] [1301-1400] [1401-1500] [1501-1600] [1601-1700] [1701-1800] [1801-1900] [1901-2000] [2001-2100] [2101-2200] [2201-2300] [2301-2400] [2401-2411]


18S rDNA from 40 beetle species

Data matrix used in Maddison, D.R., Baker, M.D., and Ober, K.A. In press.A preliminary phylogenetic analysis of 18S ribosomal DNA of carabid beetles (Coleoptera: Carabidae). Boll. Mus. reg. Sci. nat. Torino.

Sites 1 through 100

Calybe        ATCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTACAAACTAT-ATTAAAGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Cymindis      GTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTACAAAATTA-ATTAAAGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Amara         ATCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTACAAACTAT-ATTAAAGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Agonum        ATCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTACAAACTAT-ATTAAAGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Discoderus    ATCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTACAAACTAT-ATTAAAGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Chlaenius     -TCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTACAAACTAT-ATTAAAGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Loxandrus     ATCACTTGCTTGTCTCAAAAAT-TAGCCATGCATGTCTAAGTACAAACTAT-ATTAAAGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Pterostichus  --CACATGCTTGTCTCAAAGAATAAGCCATGCATGTCTAAGTACAAACTAT-ATTAAAGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Galerita      ATCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTACAAACTAT-ATTAAAGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Pseudaptinus  ATCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTACAAACTAT-ATTAAAGTGAAACTGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Pseudomorpha  --CATATGCTTGTCTCAAAGAATAAGCCATGCATGTCTAAGTACAAACTAT-ATTAAAGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Morion        --CATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTACAAACTAT-ATTAAAGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Psydrus       ATCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTCAGTACAAACCAA-ATTAAGGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Diplous       --CACATGCTTGTCTCAAAGAT-AAGCCATGCATCTCTCAGTACAAGCCAA-ATTAAGGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Patrobus      GTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTCAGTACAAGCCAT-ATTAAGGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Zolus         ATCATATGCTTGTCTCAAAGAT-AAGCCATGCATGTCTCAGTACAAACTAA-ATTAAGGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Sloaneana     -----TTGCTTGTCTCA-GGATTAAGCCATGCATGTCTCAGTACAAACTAA-ATTAAAGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Diplochaetus  --------TTTGTTTCAAGGATTAAGCCATGCATGTCTCAGTACAAGCCAA-ATTAAGGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Pericompsus   GTCATATGCTTGTTTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTCAGTACAAGCCAA-ATTAAGGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Bembidion     -TCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTCAGTACAAGCCAA-ATTAAGGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Asaphidion    -TCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTCAGTACAAGCCAA-ATTAAGGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Trechus       ---------TTGTCTCAGGTATTAGGCCATGCATGTCTCAGTACAAGCCAT-ATTAAGGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Pasimachus    -TCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTACATACTAT-AATAAAGTAAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCATTA
Scarites      -TCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTACAAACTAA-ATTAAAGTAAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Clivina       --------------TCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTCAGTACAAGCCAA-ATTAAGGTGAAACCGCGAAAAGCTCATTAAATCAGTTATGGTTTCTTA
Schizogenius  -------------------------------------------CAAGCTAA-ATTAAAGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Dyschirius    ATCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTCAGTACAAGCCAA-ATTAAGGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Loricera      GTCATATGCTCGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTACAAGCTAA-AATAAAGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Calosoma      -TCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTCAGTACAAGCCAA-ATTAAGGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Scaphinotus   ---------------------------------TGTCTCAGTACAAGCCAAAAATAAGGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Elaphrus      -TCATATGCTTGTCTCAAAGAT-AAGCCATGCATGTCTCAGTACAAGCCAA-ATTAAGGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Blethisa      ----------------------------ATGCATGTCTCAGTACAAGCCAA-ATTAAGGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Notiophilus   GTCATATGCTTGTCTCAAGGATTAAGCCATGCATGTCTCAGTACAAGCCAA-ATTAAGGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Nebria        -TCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTCAGTACAAGCCAA-ATTAAGGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Leistus       ATCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTCAGTACAAGCCAA-ATTAAGGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
T. holmbergi  ---------TTGTCTCAAAGATAAAGCCATGCATGTCTCAGTACAAGCCAA-ATTAAGGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
T. gibbsii    -----------------AAGATTAAGCCATGCATGTCTCAGTACAAGCCAA-ATTAAGGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Tenebrio      GTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTCAGTACAAGCCGA-ATTAAGGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Dynastes      ATCATATGCTTGTCTCAAAGAT-AAGCCATGCATGTCTCAGTACGAGCCGT-ATTAAGGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
Xanthopygus   -TCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTCAGTACAAGCCAA-ATTAAGGTGAAACCGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTA
              ==========                                                                                          
Character excluded from all analyses indicated by a = in the line under the matrix; boundary regions indicated by *